Основное отличие школьного педагога-организатора от вожатого заключается в должностных обязанностях:

• Педагог-организатор в школе занимается с несколькими классами, с которыми к тому же работают ещё и учителя. 1 Он проводит праздники и различные мероприятия в образовательном учреждении, выявляет потребности и увлечения учеников с учётом их возрастных и психологических особенностей и обеспечивает условия реализации их творческого потенциала. 2
• Вожатый на протяжении 21 дня следит за своими группами, ни с кем их не разделяя и занимаясь только ими. 1

Таким образом, педагог-организатор работает с несколькими классами и разделяет их с учителями, в то время как вожатый занимается только своей группой на определённом отрезке времени. 1