Основной пищей орла-гарпии являются ленивцы, мелкие обезьяны и другие млекопитающие, обитающие на деревьях. 15

Во второстепенный рацион входят рептилии и крупные птицы. 2 В частности, в него входят агути, носухи, опоссумы, броненосцы, муравьеды, змеи диаметром до 5 см, ящерицы и амфисбены. 2

Среди птиц — краксы, кариамы, попугаи-ара, туканы и другие. 2

Также орлы-гарпии охотятся на цепкохвостых дикобразов. 2