Ведомственные образовательные учреждения принадлежат какому-либо предприятию или ведомству и предназначены для детей сотрудников этой организации. dzen.ru Например, в ведомственные детские сады берут только детей сотрудников конкретного предприятия. dzen.ru
Муниципальные образовательные учреждения находятся в ведении и на финансировании муниципальных властей. spravochnick.ru Это расположенные на территории муниципального образования дошкольные и общеобразовательные учебные заведения, обеспечивающие подготовку детей, проживающих в данном образовании. spravochnick.ru
Таким образом, основное отличие заключается в том, что ведомственные учреждения ориентированы на определённую категорию сотрудников и имеют специфическое финансирование за счёт предприятия или ведомства, а муниципальные учреждения обеспечивают образование детей всего муниципального образования в целом. dzen.ru {9-host}
Например, в ведомственных образовательных организациях силового блока ведётся подготовка курсантов к первичной офицерской должности, в отличие от гражданских учебных заведений, где специалист с высшим образованием готовится без учёта конкретной должности. cyberleninka.ru