Транспортные среды и дифференциальные среды в микробиологии отличаются по назначению и целям использования.

Транспортные среды используют для сохранения жизнеспособности микроорганизмов от момента взятия материала до его посева. 12 Их состав должен позволить предотвратить избыточное размножение сопутствующей микрофлоры во время транспортировки и хранения. 1 Примеры транспортных сред: среда Эймса, среда Кери-Блэйр. 1

Дифференциальные среды применяют для изучения биохимических свойств и дифференцирования микроорганизмов разных групп по характеру их ферментативной активности по отношению к определённым типам субстрата (углеводы, аминокислоты и др.), индикаторам. 12 Состав этих сред подбирают с таким расчётом, чтобы чётко выявить наиболее характерные свойства определённого вида. 5 Примеры дифференциальных сред: среда Эндо, агар МакКонки, среда СШ (Плоскирева), хромогенный агар для обнаружения и подсчёта уропатогенных бактерий. 1