Разные порядки цианобактерий отличаются способом деления клеток и формой трихомов (разветвлённые или неразветвлённые, однорядные или многорядные). 35

Согласно Международному кодексу номенклатуры бактерий, выделяют пять порядков цианобактерий: 2

1. Chroococcales. 12 Одноклеточные, размножаются почкованием или бинарным делением, для них характерно образование чехлов вокруг клеток. 12
2. Pleurocapsales. 12 Одноклеточные, размножаются множественным делением или одновременно бинарным и множественным делением. 12
3. Oscillatoriales. 12 Многоклеточные нитчатые, трихомы состоят из ряда вегетативных клеток, неветвящиеся. 12
4. Nostocales. 12 Многоклеточные нитчатые, трихомы состоят из ряда вегетативных клеток, встречаются гетероцисты и акинеты, неветвящиеся. 12
5. Stigoneomatales. 12 Вегетативные клетки способны делиться в нескольких плоскостях, в результате чего формируются нити с истинным ветвлением или многорядные трихомы. 12