Чем отличаются прямые и косвенные значения корней в русском языке?

Возможно, имелись в виду прямые и косвенные значения корней, которые связаны с разными понятиями.

Прямое значение корня определяется по исходному непроизводному слову. kpfu.ru В зависимости от частеречной принадлежности корни могут иметь предметное, процессуальное, признаковое, количественное значения. kpfu.ru

Пример: слово «заваривание» образовано от глагола «варить», поэтому корень в нём имеет значение действия. kpfu.ru

Косвенное значение корня может быть связано с разными понятиями, например, через омонимичные корни, которые пишутся одинаково, но имеют разное значение. rutube.ru

Пример: слова «водяной», «подводный», «водоросли», «водичка», «водомерка» имеют общий корень «вод». www.yaklass.ru Их значение так или иначе связано с водой: водоросли — то, что растёт на дне водоёма, водомерка — насекомое, быстро скользящее по поверхности воды, водопад — поток воды, падающий с отвесной горы. www.yaklass.ru

Слова «водяной» и «водитель» однокоренные, так как имеют общий корень «вод», но не родственные, так как имеют разные значения: слово «водяной» связано со словом «вода», слово «водитель» — со словом «водить». www.yaklass.ru