Основные отличия плавников лучепёрых и лопастепёрых рыб:

• У лучепёрых рыб плавники состоят из костных лучей, не соединённых между собой. 5 Парные плавники не имеют центральной оси: лучи расходятся от пояса конечности веерообразно. 1
• У лопастепёрых рыб плавники представляют собой короткие лучи, расположенные вокруг мускулистой центральной почки, поддерживаемой суставчатыми костями. 3 Парные плавники напоминают конечности наземных животных: они имеют центральную ось. 1

Кроме того, лопастепёрые рыбы обладают двумя спинными плавниками с отдельными основаниями, в отличие от единственного спинного плавника лучепёрых рыб. 24