Области кода и обычные комментарии в 1С отличаются по назначению и способу использования:

1. Области кода позволяют группировать произвольный участок кода в отдельную именованную область. 2 Для этого нужно поместить код между открывающей #Область и закрывающей #КонецОбласти директивами. 2 Такой код можно свернуть или развернуть одним кликом мыши. 2
2. Обычные комментарии служат для описания сложных участков кода, алгоритма, функций и процедур, а также для выделения изменений в коде. 3 Они имеют специальный формат и служат для выделения модификаций. 3

Таким образом, основное отличие в том, что области кода помогают организовывать и структурировать код, а обычные комментарии используются для его описания и выделения изменений.