Несогласованные приложения и сложные слова в русском языке отличаются по своим характеристикам и функциям:

1. Несогласованные приложения не склоняются вместе с определяемым словом, всегда сохраняя форму именительного падежа. 14 К ним относятся собственные имена неодушевлённых объектов (выделяются кавычками) и некоторые географические названия. 1
2. Сложные слова характеризуются наличием нескольких корней в своём составе. 2 Они имеют собственное лексическое значение и грамматические особенности. 5

Таким образом, основное отличие в том, что приложение возможно убрать из предложения без значимой потери смысла, в то время как сложное слово невозможно сократить, сохранив при этом идентичное лексическое значение. 36