Методы исследования в эмбриологии и гистологии отличаются предметом изучения:

• Эмбриология изучает закономерности образования и развития зародыша. 2 Для этого используются, например, визуальное наблюдение развития зародышей, изучение фиксированных зародышей на разных этапах с последующей микроскопией, маркировка клеток с последующим прослеживанием их перемещений в тканях и органах зародыша, микрохирургия (удаление отдельных частей зародыша) и трансплантация части от одного зародыша к другому. 1
• Гистология изучает закономерности развития, строения и жизнедеятельности тканей живых организмов. 25 Основным методом исследования в этой науке является микроскопирование (световая, специальные методы микроскопирования, электронная микроскопия). 1