Некоторые отличия классификации животных по Линнею и современных биологических систем:
Линнейская система основана на делении организмов на группы по определённым характеристикам, таким как форма листа или наличие цветка. 9 В результате близкого по генетике организма могут отнести в разные группы, а далёкие по генетическому родству — в одну. 9 Кроме того, система Линнея не предусматривает учёт эволюции. 9
Современная систематика для классификации организмов использует целый комплекс признаков. 1 Учитываются, например, внешнее и внутреннее строение, история эволюционного развития на основе палеонтологических данных, процессы жизнедеятельности и биохимические особенности, эмбриональное развитие, особенности строения клеток, кариотип, распространение на планете. 1
Таким образом, современная систематика позволяет классифицировать организмы на основании их эволюционного родства, а не только сходства по тому или иному признаку. 1
При этом система Линнея заложила основы для современной классификации организмов, а в основе систематики лежат два главных принципа, введённые Линнеем: иерархичность (соподчиненность) и бинарная номенклатура. 1