Чем отличаются аллельные гены от альтернативных генов?

Возможно, имелись в виду понятия «аллельные гены» и «альтернативные признаки».

Аллельные гены — это гены, расположенные в одних и тех же локусах гомологичных хромосом и контролирующие развитие альтернативных признаков (доминантных и рецессивных). resh.edu.ru www.ulsu.ru

Альтернативные признаки, в свою очередь, — это взаимоисключающие, контрастные признаки. resh.edu.ru

Таким образом, аллельные гены — это гены, отвечающие за альтернативное развитие одного и того же признака, а альтернативные признаки — это сами эти признаки.