Аффиксы и корневые морфемы отличаются по своим функциям и положению в слове. foxford.ru ru.wikipedia.org
Корневая морфема — основная значимая часть слова, обязательная для любого слова, без неё не существует слов. foxford.ru ru.wikipedia.org Корневые морфемы могут образовывать слово как в сопровождении аффиксов, так и самостоятельно. foxford.ru
Аффикс — вспомогательная часть слова, присоединяемая к корню и служащая для словообразования и выражения грамматических значений. foxford.ru ru.wikipedia.org Аффиксы не могут самостоятельно образовывать слово — только в сочетании с корнями. foxford.ru
Кроме того, корень — индивидуальная морфема, каждая группа однокоренных слов имеет свою единственную корневую морфему, не повторяющуюся в словах других гнёзд. koi.tspu.ru Аффикс — типовая морфема, повторяющаяся в целых разрядах слов. koi.tspu.ru