Некоторые отличия строения лопастепёрых и костных рыб:

• Плавники. У лопастепёрых рыб они мясистые, соединены с телом одной костью и имеют центральную ось, напоминающую конечности наземных животных 134. У костных рыб плавники поддерживаются костными лучами. 8
• Скелет. У лопастепёрых рыб он расчленённый, с сложной мускулатурой. 69 У костных рыб скелет полностью окостеневает в процессе индивидуального развития, хорда сохраняется только у зародышей, чешуя костная. 45
• Плавательный пузырь. У лопастепёрых рыб он есть, но видоизменённый, соединённый с пищеводом. 69 У костных рыб плавательный пузырь обычно развит. 45