Основные отличия строения клетки радиолярий от строения клетки фораминифер:

1. У радиолярий скелет находится внутри клетки. 46 Он состоит из хитина, аморфного диоксида кремния или сернистого стронция. 4 Наружная и внутренняя зоны цитоплазмы разделены плотной белковой стенкой — центральной капсулой, имеющей поры. 2
2. У фораминифер скелет внутренний. 35 Часть периферической цитоплазмы находится вне раковины и покрывает последнюю снаружи в виде тонкого слоя. 3 Таким образом, скелет фораминифер — не наружный, а внутренний. 3

Кроме того, у радиолярий много игловидных псевдоподий, поддерживаемых пучками микротрубочек, которые способствуют плавучести радиолярии. 7 У фораминифер через устье наружу выдаются многочисленные очень длинные и тонкие псевдоподии, ветвящиеся и анастомозирующие между собой. 8