Состав цитоплазмы у эукариот и прокариот отличается наличием или отсутствием определённых структур. 19
У эукариот цитоплазма включает ядро и другие связанные с мембраной органеллы, такие как митохондрии и эндоплазматический ретикулум. 45 Также в её состав входят цитозоль (жидкая часть), органеллы и включения (запасные питательные вещества, секреторные продукты, гранулы пигментов). 10
У прокариот цитоплазма не отделена от генома, структурно связанного с плазматической мембраной. 10 Она не содержит органелл, кроме рибосом, и цитоскелета. 10 Генетическая информация в виде кольцевой ДНК хранится непосредственно в цитоплазме и образует структуру — нуклеоид. 3