Протозоология и протистология могут рассматриваться как синонимы, так как это разделы зоологии, изучающие одноклеточные организмы. 15
Однако есть мнение, что объём и содержание протистологии трактуются по-разному. 5 По одной из точек зрения, в сферу изучения входят одноклеточные животные с гетеротрофным типом питания, а также низшие одноклеточные и колониальные зелёные организмы с автотрофным типом питания. 15 По другой, к простейшим причисляют лишь одноклеточные гетеротрофные организмы, а автотрофные, снабжённые хлорофиллом, — к водорослям. 15
Таким образом, различие заключается в том, что объём изучаемых организмов в протистологии может быть шире, чем в протозоологии, в зависимости от точки зрения учёных.