Прототрофность в контексте пластического обмена — это способность синтезировать все необходимые вещества самостоятельно из простых предшественников. 1 Прототрофы не нуждаются в большом количестве витаминов и незаменимых веществ. 1

Ауксотрофия — это характеристика организмов, которые не способны синтезировать определённое органическое соединение, необходимое для роста этого организма. 1 Они ассимилируют эти соединения и другие факторы роста в готовом виде из окружающей среды или организма хозяина. 4

Таким образом, основное отличие в том, что прототрофы синтезируют вещества самостоятельно, а ауксотрофы нуждаются в дополнительных факторах роста, так как утратили способность к синтезу одного из веществ, необходимых для их роста (аминокислоты, витамина и др.). 34