Некоторые отличия процесса синтеза иРНК у прокариотов и эукариотов:

• Локализация. 29 В клетках прокариотов иРНК образуется в цитоплазме, поэтому образовавшиеся молекулы могут сразу принимать участие в синтезе белков на рибосомах. 2 В клетках эукариот транскрипция происходит в ядре, поэтому иРНК сначала через поры в ядерной мембране выходит в цитоплазму. 2
• Сопряжение транскрипции и трансляции. 1 У прокариотов эти процессы совмещены: рибосомы могут присоединиться к свободному 5'-концу РНК и начать её трансляцию ещё до завершения транскрипции. 1 У эукариот трансляция не совмещена напрямую с транскрипцией: обработка иРНК и транскрипция могут проходить одновременно. 6
• Созревание иРНК. 16 У прокариотов РНК сразу после синтеза готова к трансляции и не требует специальной обработки. 6 У эукариот незрелая иРНК подвергается интенсивным модификациям: из неё удаляются участки, не кодирующие белок (интроны), а оставшиеся последовательности (экзоны) сшиваются между собой. 56