Чем отличается подзаголовок от аннотации в академической публикации?

Возможно, имелись в виду различия между подзаголовками и аннотацией в научной статье.

Подзаголовки облегчают восприятие текста и помогают выделить ключевые моменты в каждом разделе. blog.rosdiplom.ru В зависимости от издания, могут варьироваться подзаголовки, которые выделяют в аннотации. vk.com Обычно это общая вводная информация и актуальность темы, цель, методы, результаты, выводы или практическая значимость. vk.com

Аннотация — это самостоятельный текст, в котором излагается суть научной статьи. vk.com В ней делают акцент на цели, вопросе или гипотезе исследования, описании ключевых методов или теоретического подхода, основных результатах и выводах. vk.com Аннотация — это то, с чего читатель начинает знакомство со статьёй. vk.com

Таким образом, подзаголовки относятся к структуре текста, а аннотация — к его краткому содержанию.