Основное отличие общей (неспецифической) трансдукции от специфической заключается в том, какие фрагменты ДНК переносятся бактериофагом. 14

При общей трансдукции фагом может быть перенесён любой фрагмент ДНК хозяина. 4 Для такой формы трансдукции не требуется состояния лизогении с внедрением профага вблизи тех бактериальных генов, которые должны быть перенесены. 3

При специфической трансдукции — лишь строго определённые фрагменты ДНК. 4 Трансдуцируется только тот фрагмент хромосомы, который расположен рядом с местом внедрения профага. 3 При специфической трансдукции происходит не замещение реципиентного гена, а добавление к геному реципиента трансдуцированного гена с образованием дупликации этого участка хромосомы. 3