Нумерическая таксономия и геносистематика отличаются подходами к классификации микроорганизмов. 14

Нумерическая таксономия (феносистематика) предполагает разделение микроорганизмов на однородные группы на основе сопоставления и анализа максимального количества признаков (морфологических, физиологических, биохимических, серологических, экологических). 1 При этом все учитываемые признаки считаются равноценными. 4 Нумерическая таксономия может применяться при оценке сходства между таксонами микроорганизмов только невысокого ранга (роды, виды). 7

Геносистематика предполагает объединение бактерий на основе степени сходства нуклеотидного состава геномов. 1 Такой подход позволяет определить не только степень похожести микроорганизмов, но и степень их родства. 1 Геносистематика занимается изучением эволюционной истории организмов по отношению к их общим предкам на основе анализа молекулярных признаков. 36

Таким образом, нумерическая таксономия фокусируется на внешних признаках организмов, а геносистематика — на их генетическом составе.