Чем отличается метод Substring от методов IndexOf и LastIndexOf при работе с массивами?

Возможно, имелись в виду методы для работы со строками, а не с массивами. Тогда есть некоторые отличия между Substring, IndexOf и LastIndexOf:

• Substring возвращает часть строки между начальным и конечным индексами или до конца строки. 1 Есть вариант, когда метод возвращает часть строки определённой длины с определённого индекса. 4
• IndexOf возвращает индекс первого вхождения символа или строки в выбранной строке. 34 Если значение не существует, метод возвращает -1. 4 Есть варианты, когда поиск начинается не с начала строки, а с определённой позиции. 4
• LastIndexOf возвращает индекс последнего вхождения символа или строки. 34 Можно задавать индекс, с которого начинать поиск, и количество проверяемых позиций. 3

Таким образом, Substring фокусируется на извлечении части строки, IndexOf и LastIndexOf — на поиске индексов вхождения элементов.