Изучение популяций растений и исследование популяций животных имеют ряд отличий. 4

Главное отличие заключается в том, что животные обладают подвижностью и могут более активно реагировать на условия внешней среды, избегая неблагоприятных обстоятельств или рассредоточиваясь по территории. 46 Подвижность облегчает им и защиту от хищников. 4 Растения прикреплены к почве и должны реагировать на меняющиеся условия за счёт морфологических и физиолого-биохимических адаптаций. 46

Размер и границы популяций растений определяются границами фитоценоза, поэтому они более очерчены, чем границы популяций животных. 1 При изучении популяций растений возникает проблема выделения внутрипопуляционных единиц: если у животных такой единицей служит особь, то у растений в качестве структурных элементов могут выступать как особи семенного происхождения, так и совокупность особей (клоны) или часть особи (побег, лист и т. п.) вегетативного происхождения. 1

Популяции разных видов существуют в разном биологическом пространстве и биологическом времени, что тоже определяет различия в исследованиях: например, чтобы изучить популяцию тли, достаточно исследовать состояние её особей на площади в несколько квадратных сантиметров, а для того, чтобы изучить популяцию слона или кита, необходимо провести учёты на площади в десятки квадратных километров. 4