Основное отличие команд dpkg-reconfigure и dpkg --configure заключается в их функциях:

• dpkg-reconfigure используется для переконфигурирования уже установленного пакета, позволяя изменять его настройки. 12
• dpkg --configure, в свою очередь, применяется для конфигурирования пакета, который был распакован, но ещё не настроен. 4 Если указать параметр -a или --pending, то будут настроены все распакованные, но не настроенные пакеты. 4

Таким образом, dpkg-reconfigure предназначен для работы с пакетами, которые уже установлены, а dpkg --configure — для пакетов, требующих настройки после их распаковки.