Функциональное моделирование отличается от других подходов в анализе бизнес-процессов, например процессного и ментального, принципами визуализации. 23

Функциональное моделирование рассматривает бизнес как функцию («чёрный ящик»). 15 В такой модели функция не имеет временной последовательности, а только точку входа и точку выхода. 15 Функциональное моделирование помогает рассматривать бизнес-модель с точки зрения результативности: при моделировании исходят из того, что имеют на входе, и того, что желают получить на выходе. 15

Процессный подход основан на последовательности действий в определённых границах. 1 При таком подходе описывают не результат, а действия, которые необходимо совершить для достижения результата. 3 Процесс можно детализировать сколько угодно — вплоть до операций каждого сотрудника. 3

Ментальный подход предполагает работу не с функциями или процессами, а с некими взаимосвязанными понятиями. 2 Характерным примером такого подхода является ментальная карта какого-либо явления. 2

Ещё одно важное отличие: функциональную модель невозможно использовать при реализации какой-либо системы, только для проектирования. 1 Процессный подход позволяет создавать исполняемые модели, которые можно в дальнейшем перевести в какую-то среду для создания системы совместной работы предприятия. 1