Чем отличается формат GFF от других форматов аннотированных биологических данных?

Формат GFF (General Feature Format) отличается от других форматов аннотированных биологических данных, например BED, тем, что использует обозначение с закрытыми интервалами на основе 1, в то время как BED применяет обозначение с полуоткрытыми интервалами на основе 0. bioinformatics.stackexchange.com

Также есть некоторые другие особенности формата GFF:

• Структура файла. biodata-analytics.sstcenter.com Для каждого признака генома отводится одна строка, каждая строка содержит 9 полей, разделённых знаком табуляции, а всей области данных предшествует область комментариев. biodata-analytics.sstcenter.com
• Гибкость. bioinformatics.stackexchange.com Формат предоставляет теги, которые связывают отдельные строки через отношения «один ко многим» (например, ген–экзон). bioinformatics.stackexchange.com
• Применение. www.biobam.com GFF используется для широкого спектра задач аннотации генома, включая картирование генома, аннотацию и сравнительную геномику. www.biobam.com
• Иерархические возможности. stepik.org В формате GFF3 предусмотрена многоуровневая иерархия признаков, допускается одновременная принадлежность одного и того же признака разным группам. biodata-analytics.sstcenter.com