Чем отличается формат ELF от Portable Executable в Windows?

ELF и Portable Executable (PE) отличаются по области применения и структуре исполняемых файлов.

ELF (Executable and Linkable Format) используется в UNIX-подобных системах, таких как Linux и большинство других версий Unix. acm.bsu.by ru.wikipedia.org Формат ELF является гибким, расширяемым и кроссплатформенным: он поддерживает различные порядковые номера и размеры адресов, поэтому не исключает какую-либо конкретную архитектуру процессора или набора команд. en.wikipedia.org

PE (Portable Executable) — формат исполняемых файлов, объектного кода и динамических библиотек, используемый в Microsoft Windows. habr.com PE представляет собой модифицированную версию COFF-формата файла для Unix. acm.bsu.by ru.wikipedia.org

Некоторые отличия структур:

• ELF использует полностью позиционно-независимый код и глобальную таблицу смещений, которая жертвует временем выполнения в пользу расходования памяти. ru.wikipedia.org ru.ruwiki.ru
• PE состоит из нескольких заголовков и секций, которые указывают динамическому компоновщику, как отображать файл в память. ru.ruwiki.ru Исполняемый образ состоит из нескольких различных областей (секций), каждая из которых требует различных прав доступа к памяти. ru.ruwiki.ru

Таким образом, ELF предназначен для использования в других операционных системах, а PE — для Windows, и структуры исполняемых файлов у них отличаются.