Эпизоотия и эпифитотия отличаются по объекту поражения и характеру заболевания.
Эпизоотия — это распространение инфекционной болезни среди одного или многих видов животных на определённой территории. 25 Для эпизоотии характерны массовость распространения, общность источника возбудителя, одновременное поражение большого количества животных, периодичность и сезонность возникновения инфекции. 3
Эпифитотия — это распространение инфекционной болезни растений на значительные территории (хозяйство, район, область) в течение определённого времени. 25 Также это может быть резкое увеличение численности вредителей растений, которое сопровождается массовой гибелью сельскохозяйственных культур и снижением их продуктивности. 15
Таким образом, эпизоотия касается животных, а эпифитотия — растений.