Экосистема и микрокосм — это разные понятия, каждое из которых имеет своё значение.

Экосистема — это единый природный комплекс, образованный живыми организмами и средой их обитания, находящихся в закономерной взаимосвязи друг с другом и образующих систему. 58 Экосистема является открытой системой и характеризуется входными и выходными потоками вещества и энергии. 8

Микрокосм — это мир малых величин (атомов, электронов и т. п.). 410 В античной натурфилософии микрокосм — это понимание человека как вселенной (макрокосм) в миниатюре. 47

Таким образом, основное отличие заключается в том, что экосистема — это природный комплекс, а микрокосм — это мир малых величин в философском понимании.