Дыхательная система хрящевых и костных рыб имеет некоторые отличия. 15

У хрящевых рыб дыхательная система представлена открытыми жаберными щелями. 9 Во время вентиляции жабр вода попадает в ротовую полость через рот и отдаёт кислород, а потом проходит между жаберными дугами и выходит наружу, забирая углекислый газ. 9

У костных рыб дыхательная система представлена жабрами, которые прикрыты жаберными крышками. 13 При поднятии жаберных крышек вода засасывается в ротовое отверстие, а при закрытии крышек вода выходит через жаберные щели, омывая лепестки. 4 Таким образом, костные рыбы могут дышать в стоячей воде, находясь на одном месте. 4