Чёрный байкальский хариус отличается от других подвидов хариуса рядом особенностей: 12

• Внешний вид. У чёрного хариуса высокие, особенно в задней части, анальный и спинной плавники, хвостовой стебель короткий и высокий. 1 Плавники и тело ярко окрашены, особенно в нерестовый период. 1
• Размер и масса тела. Чёрный хариус достигает длины 60 см и массы тела до 1,5 кг. 1
• Место обитания. Чёрный байкальский хариус обитает в реках, впадающих в озеро, а также в прибрежье Байкала и в его заливах, преимущественно на участках с каменисто-галечным дном. 1

Для других подвидов хариуса характерны свои особенности, например:

• Западносибирский подвид. Имеет относительно короткий и широкий спинной плавник с рисунком из крупных пятен с ярким металлическим блеском. 3
• Восточносибирский подвид. В задней части огромного спинного плавника (у некоторых самцов он может достигать основания хвостового плавника) между лучами видно 5–7 сплошных полосок тёмно-красного цвета. 3
• Камчатский подвид. Отличается сравнительно большой головой и пастью, а тело усеяно многочисленными пятнами, которые чуть ли не соединяются друг с другом. 4