Основные отличия лучепёрых рыб от лопастепёрых:

• Строение парных плавников. 1 У лучепёрых парные плавники не имеют центральной оси: лучи их плавников расходятся от пояса конечности веерообразно. 1 Парные же плавники лопастепёрых напоминают конечности наземных животных: они имеют центральную ось. 1
• Наличие плавательного пузыря. 2 У лопастепёрых он есть, но они быстро превратили его в орган дыхания. 2 Лучепёрые же сделали его в основном органом гидростатического равновесия и способом поддержания плавучести. 2
• Скелет. 68 В отличие от лопастепёрых, лучепёрые, как правило, обладают костным позвоночником, и только у немногих сохраняется хорда или её остатки. 68