Клубень — это утолщённый боковой побег, иначе говоря, сильно увеличенное в размерах корневище. 1 Он образуется на конце длинного подземного побега — столона. 2 На клубне есть глазки, из которых в дальнейшем могут развиться новые побеги. 2 Примеры растений, образующих клубни: картофель, топинамбур. 2

Плод — это видоизменённый в процессе двойного оплодотворения цветок, орган размножения покрытосеменных растений, образующийся из одного цветка и служащий для формирования, защиты и распространения заключённых в нём семян. 3

Таким образом, основное отличие в том, что клубень — это часть растения, а плод — это орган с определённой функцией.