Дизентерийная амёба отличается от других видов простейших рядом особенностей:

• Размер: дизентерийная амёба мельче обыкновенной амёбы. 13
• Ложноножки: у дизентерийной амёбы они меньше, чем у обыкновенной. 1
• Эктоплазма: чётко отграничена от эндоплазмы. 1
• Псевдоподии: короткие и широкие. 1
• Характер движения: псевдоподия выбрасывается мгновенно, а при перемещении в неё эндоплазмы движение становится поступательным. 8

Кроме того, дизентерийная амёба содержит в протоплазме эритроциты, в то время как непатогенная амёба их не имеет. 8