Некоторые особенности нотации для этнических инструментов, в том числе флейты, могут включать:

• Отсутствие строгой звуковысотности и чёткой структурной и временной регламентации. 3 Например, в японской музыке хонкеку, к которой относится флейта сякухати, существенны касания тембра инструмента в низком регистре, а мелодика как таковая не выстраивается или выражена мотивами-намёками. 3
• Использование авангардной нотации. 3 Например, пьеса «Цуру но Сугомори» для современной европейской флейты, аранжированная голландским флейтистом и композитором Вилом Оффермансом, записана с помощью авангардной нотации. 3 Запись построена на свободно-темпово-ритмическом преломлении репетитивности, которая постепенно оттесняется волнообразными ходами, а итогом выступает мелодическая конструкция по восходящим квартам. 3

Также для записи особых приёмов звукоизвлечения может использоваться изменённый нотный стан. 1