Ключевые различия между махо-сёдзё и другими поджанрами аниме и манги заключаются в следующих особенностях:

• Сюжет: махо-сёдзё рассказывает о приключениях девочек, наделённых магической силой. 1 Героини получают свои силы при перевоплощении с помощью специального магического артефакта и должны скрывать свои способности от окружающих. 2
• Целевая аудитория: несмотря на то, что жанр относится к сёдзё, некоторые произведения в нём создаются с ориентацией на мужскую аудиторию. 1
• Лейтмотивы: в махо-сёдзё основными являются волшебство, комедия, романтика и иногда повседневность. 3

В то же время, например, в сэйнэне больше реализма и драматизации событий, авторы обычно не фокусируются на фантастических элементах и пытаются практически задокументировать повседневную жизнь героев. 3