Некоторые ключевые отличия между оригинальным аниме «Наруто» и продолжением «Шиппуден»:

• Связность истории. 1 В оригинальном «Наруто» история кажется более связной, второстепенным персонажам выделены соответствующие моменты. 1 В «Шиппуден» некоторые фанаты отмечают более масштабные сражения и наличие бонусов. 1
• Качество сюжетных арок. 1 Некоторые считают, что в оригинальном «Наруто» дуги более качественные: например, в нём лучше проработаны экзамены на чуунина, возвращение Саске и «Страна волн». 1 В «Шиппуден» некоторые отмечают, что боевая арка заняла большую часть сериала и не всегда была удачной. 1
• Похороны персонажей. 2 После окончания войны в «Шиппуден» провели расширенные похороны всех, кто погиб во время войны, в то время как в манге похороны проводились специально для Неджи. 2

Выбор между оригинальным аниме «Наруто» и «Шиппуден» зависит от личных предпочтений зрителя.