Литературное наследие Кариона Истомина обширно и разнообразно. 2 Вот некоторые его произведения:

• Стихотворения. 13 Среди них акафисты, эпитации, богословские трактаты, наставления о воспитании детей, панегирики, связанные с различными событиями придворной жизни. 1
• Книга «Полис». 14 Это стихотворная энциклопедия, содержащая характеристику двенадцати различных наук, времён года и стран света. 1
• Буквари. 4 Наибольшую известность имеют «Большой букварь» (1694) и «Лицевой букварь» (1694). 15 Это первые иллюстрированные русские азбуки, которые можно считать своеобразными детскими энциклопедиями. 1
• «Домострой». 14 В нём автор изложил наставления детям и их родителям. 4
• Победная ода, посвящённая крымскому походу русского воинства под командованием В. В. Голицына. 2
• Сборник проповедей «Веселеил, си есть Скиния Божия». 2
• Переводы, в том числе Блаженного Августина «Боговидная любовь» и римского сенатора Секста Юлия Фронтина «О случаях военных». 2