Разница между псевдонимами и криптонимами заключается в цели использования и характере имён.

Псевдоним — это вымышленное имя, которое человек использует в публичной или профессиональной деятельности вместо настоящего, данного при рождении и зафиксированного в официальных документах. 3 К псевдонимам прибегают, например, при неблагозвучии настоящего имени, желании сохранить инкогнито или в целях сознательной мистификации. 8

Криптоним — это подпись под произведением вместо имени автора, которая не предполагает возможности отождествить её с тем или иным конкретным лицом. 16 Криптонимы рассчитаны на то, чтобы скрыть подлинного автора произведения. 16 Обычно их используют при обнародовании рискованных произведений или тех, которые отличаются от той творческой деятельности, с которой уже прочно связано подлинное имя автора. 16

Таким образом, псевдонимы используются для замены настоящего имени, а криптонимы — для сокрытия авторства определённых произведений.