Разница между культурной и биологической ассимиляцией заключается в контексте и определении этих понятий.

Культурная ассимиляция рассматривается в социологии и этнографии и означает потерю одной частью социума (или целым этносом) своих отличительных черт и их замену позаимствованными у другой части (другого этноса). 14 Это этнокультурный сдвиг в идентичности определённой социальной группы, ранее представлявшей иную общность в плане языка, религии или культуры. 14

Биологическая ассимиляция означает совокупность процессов биосинтеза органических веществ с затратой энергии в живом организме. 38 В ходе ассимиляции образуются сложные белки, жиры, нуклеиновые кислоты и углеводы из простых веществ, для дальнейшего использования как «строительный материал» клетки и получении энергии. 38

Таким образом, культурная ассимиляция связана с социальными и культурными процессами, а биологическая ассимиляция — с биологическими процессами организма.