Отличие алфавита межславянского языка от традиционных славянских алфавитов заключается в использовании двух систем письма: кириллицы и латиницы. 38

В межславянском языке есть официальная орфография для обоих алфавитов. 3 Некоторые особенности использования латиницы и кириллицы:

• Латиница: для написания шипящих включены буквы «č», «ž», «š» и для ятя — «ě». 7
• Кириллица: для палатализации в неё включили «ь» и для йотации — «j». 7
• Для передачи звуков, которые в русском языке выражают буквы «Ё» и «Я», используются диграфы «ЙО/JO» и «ЙА/JA». 8

Также существует расширенный вариант орфографии межславянского языка, именуемый «научным межславянским». 10 Он включает в себя 14 дополнительных букв для латиницы и 7 дополнительных букв для кириллицы. 10