Сен-Санс внёс значительный вклад в развитие органной музыки, в частности в искусство органной импровизации. 14 Музыкант достиг такого уровня мастерства, что исполнение на органе написанной пьесы ничем не отличалось от импровизированной. 4

Некоторые достижения Сен-Санса в области органной музыки:

• Создание «Трёх рапсодий на темы бретонских народных песен». 1 В этих произведениях отразился интерес композитора к французской народной музыке. 1
• Использование органа в ансамблевых и оркестровых произведениях. 1 Например, Сен-Санс применял орган в Третьей симфонии, которая была впервые исполнена в Лондонском филармоническом обществе в 1886 году. 3
• Введение новых приёмов в органное письмо. 1 В фактуре органных произведений Сен-Санса встречаются фортепианные приёмы, появившиеся в арсенале пианистов благодаря Ференцу Листу (аккордовые репетиции, октавная техника). 1
• Написание двух сборников прелюдий и фуг. 2 Некоторые из ранних произведений были написаны как для фисгармонии, так и для органа, а несколько — только для органа. 2