Происхождение считалки «Эники-беники» имеет несколько версий: 1

• Версия с вилкой. 1 Журналист Игорь Тарабукин обнаружил в словаре Даля термин «бенечка», который был в обиходе в Ярославской губернии. 12 Так называли обычную вилку. 12 Тарабукин предположил, что «беники» — производная от этого слова. 2
• Версия с игрой в кости. 1 Лингвист Владимир Орёл утверждал, что выражение позаимствовали в немецком языке. 2 У рыцарей Германии существовала присказка, которую произносили во время игры в кости: «Einec beinec doppelte». 2 В переводе означает: «кость удвоилась». 2
• Версия с молитвой. 1 Исследовательница Марина Резникова возводит детскую считалочку к молитве тюркскому божеству Умай. 2 Древние половцы начинали поклонение ей со слов «Энныке-бэнныке», то есть, «Мать Всемогущая». 2

Культурное значение считалки может заключаться в том, что её использовали для игр, например, чтобы выбрать ведущего. 2

Следует учитывать, что однозначного мнения о происхождении и культурном значении считалки «Эники-беники» нет, и существует множество версий.