Софья Прокофьева оставила значительное творческое наследие, в частности:

• Более тридцати книг, среди которых «Приключения жёлтого чемоданчика», «Волшебная пилюля, или „Приключения жёлтого чемоданчика — 2“», «Девочка-свеча», «Удивительные приключения мальчика без тени и тени без мальчика», «Клад под старым дубом» и другие. 5
• Цикл сказок о приключениях Белоснежки, состоящий из 18 книг. 4
• Пересказы произведений европейского фольклора для детей: о детстве Роланда, короля Артура и Парсифаля, легенд Сельмы Лагерлёф. 12
• Пьесы, написанные в соавторстве с Генрихом Сапгиром: «Кот в сапогах», «Василиса Прекрасная», а с Ириной Токмаковой — «Стрела Робин Гуда», «Андрей Стрелок и Марья Голубка». 12
• Сценарии, по которым сняты мультипликационные фильмы: «Лоскутик и облако», «Остров капитанов», «Ученик волшебника», а также игровые фильмы — «Пока бьют часы», «Оставь окно открытым», «Без свидетелей». 12

Произведения Софьи Прокофьевой получили читательское признание не только в России, но и за рубежом — они переведены более чем на двадцать языков. 14

Писательница — лауреат ряда международных премий за книги и киносценарии. 34 В 2006 году она была награждена Почётным дипломом Международного совета по детской книге (IBBY) за книгу «Глазастик и ключ-невидимка». 4