Некоторые уникальные коллекции, которые хранятся в Краснодарском краевом художественном музее имени Ф. А. Коваленко:

• Коллекция отечественного искусства начала XX века. 1 Включает более ста произведений, среди которых работы Казимира Малевича, Ольги Розановой, Ивана Гавриса, Александры Экстер и других авангардистов. 1
• Коллекция древнерусской живописи. 1 Включает около семидесяти произведений. 1
• Коллекция японской гравюры XVIII–XIX веков. 1
• Коллекция французской графики, среди которой — недатированный рисунок французского живописца XIX века Эмиля-Жана-Ораса Верне. 4
• Коллекция работ известных живописцев. 1 В ней представлены картины В. Л. Боровиковского, Ф. А. Матвеева, Е. Д. Камеженкова, Ф. А. Бруни, Д. Г. Левицкого, К. П. Брюллова, С. Ф. Щедрина, И. К. Макарова, А. О. Орловского, В. А. Тропинина, И. К. Айвазовского, А. Г. Венецианова, В. Е. Маковского, И. И. Шишкина, Ю. Б. Левитана, В. И. Сурикова, А. М. Васнецова, В. Д. Поленова, И. Е. Репина и других. 1
• Коллекция работ кубанских художников. 1 В ней представлены картины Ивана Захарова, Ольги Беднаржик, Сергея Воржева, Александра Луицкого, Георгия Анциферова, Мхитара Асланяна, Григория Булгакова, Александра Калугина, Николая Туркова, Людмилы Котелевской, Дмитрия Прокоповича, Ольги Трапицыной, Юлии Поповой и других мастеров. 1