Некоторые награды и премии, которые получил Сергей Пускепалис за свою театральную и кинодеятельность:

• 1999 — почётное звание «Заслуженный артист Российской Федерации» — «за заслуги в области искусства». 15
• 2007 — приз за лучшую мужскую роль на кинофестивале «Кинотавр» за роль в фильме «Простые вещи». 15
• 2007 — премия «Ника» в номинации «Открытие года» за роль в фильме «Простые вещи». 15
• 2007 — премия киноведов и кинокритиков «Белый слон» в номинации «Лучшая мужская роль» за роль в фильме «Простые вещи». 15
• 2010 — «Серебряный медведь» за лучшую мужскую роль в фильме «Как я провёл этим летом» (вместе с Григорием Добрыгиным) на Берлинском кинофестивале. 15
• 2013 — приз за лучшую мужскую роль XIX Российского кинофестиваля «Литература и кино» в Гатчине за роль в фильме «И не было лучше брата». 13
• 2014 — приз Ассоциации продюсеров кино и телевидения в номинации «Лучший актёр телевизионного фильма/сериала» (за роль Ивана Митина в сериале «Крик совы»). 13
• 2015 — лауреат Премии ФСБ России. 1
• 2015 — приз за лучшую режиссёрскую работу («Клинч») на фестивале «Амурская осень» в Благовещенске. 12
• 2016 — приз за лучший дебют и приз прессы на кинофестивале «Виват кино России!» в Санкт-Петербурге (фильм «Клинч»). 12
• 2018 — премия «Золотой орёл» в номинации «Лучшая мужская роль на телевидении» за 2017 год за главную роль в телесериале «А у нас во дворе…». 12
• 2021 — Благодарность Президента Российской Федерации (4 мая 2021 года) — за большой вклад в подготовку и проведение общественно значимых мероприятий. 15
• 2023 — Орден Мужества (26 января 2023 года, посмертно) — за мужество и отвагу, проявленные при исполнении гражданского долга. 15
• 2024 — премия «Ника» за лучшую мужскую роль в фильме «Сердце Пармы». 5