В современной альтернативной музыке используются разные музыкальные инструменты, так как жанр не имеет обобщающего музыкального стиля. 4

Некоторые инструменты, которые могут применяться в разных направлениях альтернативной музыки:

• Гитары. 14 В некоторых жанрах, например в шугейзе, для искажения звучания используют множество эффектов. 1
• Ударные инструменты. 2 В шугейзе они проявляются случайно, их вдохновляют не рок-стили, а хип-хоп и джангл. 2
• Вокал. 12 В шугейзе голос солиста из средства донесения текста превращается в самостоятельный инструмент, который нужен для создания дополнительного музыкального слоя. 1

Также в альтернативной музыке могут сочетаться акустические и электронные инструменты. 1