Музейный комплекс Национального музея Южной Кореи организован следующим образом: 1

1. Первый этаж посвящён доисторическому периоду, начиная со времён палеолита. 4 Коллекция из примерно 4500 артефактов размещена в девяти экспозиционных залах, в которых последовательно представлены культуры палеолита, неолита, бронзового века и другие. 1
2. Второй этаж посвящён искусству и каллиграфии. 4 Здесь находятся, например, Галерея даров с 800 экспонатами в 11 залах, названных именами дарителей, и три галереи корейской каллиграфии и живописи, галерея корейской буддистской живописи и галерея деревянных и лакированных изделий. 1
3. Третий этаж посвящён скульптурам и ремёслам. 4 Здесь представлена, в частности, Галерея скульптур и ремёсел, насчитывающая 630 экспонатов, представляющих корейскую буддийскую скульптуру и изделия народных промыслов. 6

Кроме того, в выставочных павильонах расположены три иммерсивные виртуальные галереи: панорамные видеопроекции шедевров корейской живописи, экскурсия в гробницы Когурё с описанием их стенных росписей и изображения высокого разрешения произведений искусства и артефактов, которые обычно находятся в хранилище музея. 1

Также на территории музейного комплекса расположены лектории, специальный детский музей, библиотека, театр Yong и ботанический сад. 1