Аллонимы и криптонимы отличаются целями использования в литературном мире.
Аллоним — это имя другого реально существующего или существовавшего лица, которое автор использует вместо собственного имени при обозначении авторства произведения. ru.wikipedia.org {7-host} Аллонимы предназначены не для того, чтобы скрыть истинное имя автора, а чтобы подчеркнуть какую-либо его особенность. ru.wikipedia.org Например, авторы поздней Античности и Средневековья использовали аллонимы, чтобы именем более раннего и авторитетного автора придать больше уважения своему произведению. ru.wikipedia.org {7-host}
Криптоним — это подпись под произведением вместо имени автора, которая не предполагает возможности отождествить её с тем или иным конкретным лицом. stihi.ru {9-host} Криптонимы рассчитаны на то, чтобы скрыть подлинного автора произведения. stihi.ru {9-host} Обычно такими подписями пользуются при обнародовании рискованных произведений или тех, которые отличаются от той творческой деятельности, с которой уже прочно связано подлинное имя автора. stihi.ru {9-host}
Таким образом, основное отличие в том, что аллонимы предназначены для подчёркивания особенностей автора, а криптонимы — для сокрытия его подлинного имени.